I rapporti diplomatici tra Italia e Giappone risalgono al 1866. Da allora si sono susseguiti alla guida dell’Ambasciata d’Italia 41 Capi Missione:
Vittorio Sallier de la Tour, Inviato Straordinario e Ministro Plenipotenziario con Lettere Credenziali (d'ora in poi, L.C.) (31 marzo 1867)
Alessandro Fé D’Ostiani, Inviato Straordinario e Ministro Plenipotenziario con L.C. (7 marzo 1870)
Raffaele Ulissa Barbolani, Inviato Straordinario e Ministro Plenipotenziario con L.C. (22 febbraio 1877)
Eugenio Martin Lanciarez, Incaricato d’Affari con L.C. (27 aprile 1882)
Renato De Martino, Incaricato d’Affari con L.C. (21 dicembre 1883)
Ercole Orfini, Inviato Straordinario e Ministro Plenipotenziario con L.C. (19 agosto 1894)
Giulio Melegari, Inviato Straordinario e Ministro Plenipotenziario con L.C. (18 aprile 1901)
Giulio Cesare Vinci, Inviato Straordinario e Ministro Plenipotenziario con L.C. (16 luglio 1904)
Giovanni Gallina, Ambasciatore Straordinario e Plenipotenziario con L.C. (31 dicembre 1907)
Alessandro Guiccioli, Ambasciatore Straordinario e Plenipotenziario con L.C. (5 luglio 1908)
Fausto Cucchi Boasso, Ambasciatore (4 dicembre 1915)
Luigi Girolamo Cusani Confalonieri, Ambasciatore (9 aprile 1917)
Raniero Paulucci di Calboli, Ambasciatore (17 febbraio 1920)
Carlo Aliotti, Ambasciatore (9 novembre 1920)
Giacomo De Martino, Ambasciatore (12 novembre 1922)
Giulio Della Torre di Lavagna, Ambasciatore (2 aprile 1925)
Pompeo Aloisi, Ambasciatore (6 gennaio 1928)
Giovanni Cesare Majoni, Ambasciatore (22 febbraio 1930)
Giacinto Auriti, Ambasciatore con L.C. (5 gennaio 1933)
Giacinto Auriti, Ambasciatore (23 ottobre 1933)
Mario Indelli, Ambasciatore (29 gennaio 1940)
Giovanni Revedin Di San Martino, Capo Missione Diplomatica Italiana (1 maggio 1947)
Blasco Lanza D’Ajeta, Capo Missione Diplomatica Italiana (15 giugno 1951)
Blasco Lanza D’Ajeta, Ambasciatore con L.C. (11 aprile 1952)
Marcello Del Drago, Ambasciatore con L.C. (26 febbraio 1955)
Cristoforo Fracassi Ratti Mentone Di Torre Rossano, Ambasciatore con L.C. (23 agosto 1956)
Maurilio Coppini, Ambasciatore con L.C. (9 maggio 1958)
Maurilio Coppini, Ambasciatore (8 agosto 1962)
Alberico Casari, Ambasciatore (30 settembre 1965)
Justo Giusti Del Giardino, Ambasciatore (15 maggio 1968)
Carlo Perrone Capano, Ambasciatore (16 marzo 1974)
Vincenzo Tornetta, Ambasciatore con L.C. (19 gennaio 1977)
Vincenzo Tornetta, Ambasciatore (4 settembre 1979)
Boris Bianchieri-Chiappori, Ambasciatore con L.C. (23 gennaio 1980)
Marcello Guidi, Ambasciatore (28 marzo 1984)
Bartolomeo Attolico, Ambasciatore con L.C. (12 gennaio 1986)
Bartolomeo Attolico, Ambasciatore (21 novembre 1986)
Paolo Galli, Ambasciatore (27 gennaio 1992)
Giovanni Dominedò, Ambasciatore (15 febbraio 1995)
Gabriele Menegatti, Ambasciatore con L.C. (29 marzo 1999)
Mario Bova, Ambasciatore (7 luglio 2003)